公司周一至周五9-21点工作，超时部分应支付加班费。根据《劳动法》规定，超出每日8小时工作制即算加班，公司需按标准支付加班费。长期不支付加班费，将严重影响员工权益，可能导致劳动争议甚至法律纠纷。
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公司超时工作应支付加班费，处理方式有协商、投诉、仲裁。可先与公司协商，协商无果可向劳动监察部门投诉，仍无法解决则可申请劳动仲裁，根据具体情况选择合适方式。
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超时工作应支付加班费。具体操作：1.核实工作时间，超出8小时部分记为加班；2.与公司协商加班费支付事宜；3.若协商不成，收集加班证据，向劳动监察部门投诉；4.投诉无果，准备材料申请劳动仲裁，维护自身权益。